围绕这个奇妙的放浪医生的第二个传说是关于他可能不举的说法。帕拉塞尔苏斯一生中有个值得注意的异常之处，那就是完全找不到他和女性有关系的痕迹。由此，他医学上的对手和敌人们就称他是被去势的男人、男同性恋等，对他进行人身攻击。有种说法是，他的男根在他小时候被猪咬掉了，从此以后他就成了完全的性无能者。但这个说法也太不着边际了。猪吃掉人阴茎的事情根本就没听说过。
闲话少提，事实上，帕拉塞尔苏斯从小时候开始就有佝偻症的倾向，体质极差。因为天生体质虚弱，所以他才放弃了肉体上的快乐，专心于掌握知识和学问，试图扭转他的劣势吧。他还是个酒鬼，可以说天天晚上都要浸泡在酒馆里。帕拉塞尔苏斯性情乖僻，却敢正面向权威发起挑战，可以说不愧是个别扭的男人了。
他成为巴塞尔大学的教授，估计是在他三十岁左右的时候。他打破自古以来的惯例，采用德语进行授课。中世纪以来，学院的教授全都身裹肥大的长袍，头上戴着红帽子，手上套着金戒指，用拉丁语进行授课，这已经是约定俗成的事情。而帕拉塞尔苏斯却以身着被药品弄脏的灰工作服、头戴朴素的黑贝雷帽的形象在学生们面前登场。这瞬间就成了一场丑闻，他开始遭受指责和攻击。

帕拉塞尔苏斯（如图）

但帕拉塞尔苏斯与城中保守派的医生和大学当局展开了勇敢的斗争。他将敌视他的医生们称为伪善者，主张自己才是被神认可的医学界王者，十分有自信。最后，他还煽动学生们在夏至节那天，将当时医学的最高权威书——伊本·西那的《医典》，投进火中焚烧。有点像今天的学生运动，莽撞的帕拉塞尔苏斯作为学生运动的先驱，向大学当局挑起了斗争。
结果，由于他过激的思想和行为，巴塞尔市的保守学者们容不下他，他于翌年开始了逃亡一样的诸国游历之旅。如前文中讲的，当时是农民起义和宗教战争的时代，他精力十足地行走于动乱的欧洲各处，所到之处对病人们治疗，足迹遍布德国、意大利、法国、荷兰、葡萄牙、英国、瑞典、波兰，甚至一直延伸到了亚洲。民间流传着不少像是在黑海沿岸的大草原被鞑靼人捉住带去了莫斯科、在土耳其的宫廷接受手术成了宦官等冒险小说一样的传闻。而他本人却炫耀道：“别人说什么都行，反正我是不记得自己去过亚洲或是非洲。”

他简直可以说是旅行方面的天才人物，在同一个城市绝不会停留超过三四个月，行事十分机灵。他被天主教徒和保守势力恨之入骨，周围到处是敌人，却能在欧洲的贵族和大商人家里来回转悠，无论走到哪儿都能受到礼遇，这实在是不可思议。不用说，就是因为他的医术高超，使他成为这个世间不可或缺的存在吧。不过，与此同时，人们心中也产生了帕拉塞尔苏斯是不是哪家秘密组织的成员这样的疑问。
在中世纪，以相互扶持的精神为出发点的手工业行会在欧洲各处遍地开花。其中被称为“共济会”的建筑师和石匠的行会在八世纪前就已存在。国王和教皇对其赋予了各种特权。另外还有被称为“玫瑰十字会”的以宗教革命为目标的国际性秘密组织，异端的法师和炼金术师们在其中暗中活动。若是属于这样的组织，无论走到哪儿，只要出示暗号和徽章就能不愁吃住。
有种说法是，帕拉塞尔苏斯是“玫瑰十字会”藏于暗中的大人物。他在当时社会怀有不满的激进知识分子贵族、大商人之间有着巨大影响力，一流的学者和艺术家也在他的面前俯首帖耳。比如巴塞尔著名的出版人、瑞士文艺复兴的推进者约翰·弗罗本，名声显赫的当代大学者伊拉斯谟，无论哪个都在帕拉塞尔苏斯治好他们的病后变得对他忠心耿耿。
实际上，据说帕拉塞尔苏斯在《预测之书》的小册子中，预言了天主教会的衰落和法国大革命的事情。从这里就可以基本上推测出他也是拥有革命思想的人。
想要对一生中写下大量文章的帕拉塞尔苏斯的学问和思想的体系一言以概之是不可能的。硬要说的话，可以将其看作一种神秘性质的自然哲学。其中既混杂着占星术和炼金术，也充斥着大宇宙小宇宙的理论。当时的医学主要还是依靠药草，而他引入了化学疗法，从这个意义上讲，他在医学上是一位先驱者。他也有像《子宫论》这样的著作，详细论述了男性的精液在密封的蒸馏器中是如何制造“何蒙库鲁兹（一种小人）”的方法，人们认为后来歌德在写《浮士德》时借鉴过这种“小人的制造法”。
1541年，帕拉塞尔苏斯在萨尔茨堡死去，年仅四十八岁。围绕他的死亡流传过各种传闻。其中一个说法是他在酒馆和人吵架然后被杀了。