围绕这个奇妙的放浪医生的第二个传说是关于他可能不举的说法。帕拉塞尔苏斯一生中有个值得注意的异常之处，那就是完全找不到他和女性有关系的痕迹。由此，他医学上的对手和敌人们就称他是被去势的男人、男同性恋等，对他进行人身攻击。有种说法是，他的男根在他小时候被猪咬掉了，从此以后他就成了完全的性无能者。但这个说法也太不着边际了。猪吃掉人阴茎的事情根本就没听说过。
闲话少提，事实上，帕拉塞尔苏斯从小时候开始就有佝偻症的倾向，体质极差。因为天生体质虚弱，所以他才放弃了肉体上的快乐，专心于掌握知识和学问，试图扭转他的劣势吧。他还是个酒鬼，可以说天天晚上都要浸泡在酒馆里。帕拉塞尔苏斯性情乖僻，却敢正面向权威发起挑战，可以说不愧是个别扭的男人了。
他成为巴塞尔大学的教授，估计是在他三十岁左右的时候。他打破自古以来的惯例，采用德语进行授课。中世纪以来，学院的教授全都身裹肥大的长袍，头上戴着红帽子，手上套着金戒指，用拉丁语进行授课，这已经是约定俗成的事情。而帕拉塞尔苏斯却以身着被药品弄脏的灰工作服、头戴朴素的黑贝雷帽的形象在学生们面前登场。这瞬间就成了一场丑闻，他开始遭受指责和攻击。

帕拉塞尔苏斯（如图）

但帕拉塞尔苏斯与城中保守派的医生和大学当局展开了勇敢的斗争。他将敌视他的医生们称为伪善者，主张自己才是被神认可的医学界王者，十分有自信。最后，他还煽动学生们在夏至节那天，将当时医学的最高权威书——伊本·西那的《医典》，投进火中焚烧。有点像今天的学生运动，莽撞的帕拉塞尔苏斯作为学生运动的先驱，向大学当局挑起了斗争。
结果，由于他过激的思想和行为，巴塞尔市的保守学者们容不下他，他于翌年开始了逃亡一样的诸国游历之旅。如前文中讲的，当时是农民起义和宗教战争的时代，他精力十足地行走于动乱的欧洲各处，所到之处对病人们治疗，足迹遍布德国、意大利、法国、荷兰、葡萄牙、英国、瑞典、波兰，甚至一直延伸到了亚洲。民间流传着不少像是在黑海沿岸的大草原被鞑靼人捉住带去了莫斯科、在土耳其的宫廷接受手术成了宦官等冒险小说一样的传闻。而他本人却炫耀道：“别人说什么都行，反正我是不记得自己去过亚洲或是非洲。”