拜占庭时代的埃及政治生活中出现了一个显著特点，即随着基督教的合法地位的确立，罗马帝国教会在埃及成为一支举足轻重的力量。由于基督教教派之间存在着分歧和冲突，亚历山大教廷与拜占庭之间关系紧张，拜占庭政府要将自己的思想强加给埃及，结果导致埃及人反抗拜占庭帝国的民族情绪越来越高涨。
拜占庭帝国统治下的埃及时期，希腊文化对埃及文化的影响已失去强劲的势头，政府倡导的罗马文化在埃及各地传播开来，但罗马文化始终没有形成一种绝对优势。埃及法老文化在埃及人的心目中依然根深蒂固，基督教文化的传入又给埃及增添了新的文化因素，因此这一时期的埃及文化呈现出一种奇妙的混合现象。4世纪的埃及至少广泛使用3种语言，即托勒密王朝时期的官方语言希腊语、戴克里先改革时引进的拉丁语和埃及人使用的土著语—科普特语。5世纪以后，科普特语在修道士和土著埃及人中逐渐占据了统治地位。到了拜占庭帝国统治的后期，埃及民族主义情绪高涨，科普特语的使用越来越广，甚至出现在官方的文件中，教会中的一些高层人士也讲科普特语，而不是希腊语和拉丁语。在宗教信仰方面，除了基督教外，埃及传统宗教仍然具有一定的影响，埃及的民族传统仍然得到了发展，崇拜古埃及神灵仍然很有市场。
6世纪末期，拜占庭帝国在埃及的统治走向了穷途末路，内忧外患使得拜占庭帝国苟延残喘，风雨飘摇，连绵不断的埃及人民大起义，特别是阿萨利亚领导的人民起义，沉重打击了拜占庭帝国在埃及的统治。