俄耳甫斯教是第一个普世的宗教，因为它不被视为是某一个部落或民族所专有的，而是向所有接受其信条的人敞开了大门。它深刻地影响了随后的所有宗教的发展。尽管如此，我们却不该认为它带来了许多智识和精神方面的精进。俄耳甫斯教的净化仪式作为整个系统的中心，仍然包含了一系列原始的禁忌——不吃肉或豆类，不触碰白色公鸡，不照光源旁边的镜子。
然而，恰恰在这一点上，毕达哥拉斯赋予了俄耳甫斯教新的意义，在这一点上，宗教直觉和理性科学以惊人的创意被融合在了一起。这个连接点就是净化的概念。这是酒神崇拜、俄耳甫斯崇拜、提洛岛的阿波罗崇拜，以及毕达哥拉斯医学和科学的一个核心概念，只是含义不同，而且应用不同的方法（现代心理治疗的各个学派也是一样）。在胡言呓语的酒神女祭司和冷傲的数学家之间，在俄耳甫斯的琴声和缓泻药丸之间，有什么共同之处吗？是的，它们都拥有对从各种形式的奴役、身心的激情和紧张、死亡和虚空、巨人留给人类的遗产中获得解放的渴望——是这种渴望重新点燃了神性的火花。然而实现这个目的的方法必然是因人而异的。这些方法必须根据信徒的悟性和入会的程度进行分级。毕达哥拉斯用不同等级的详尽复杂的净化方法，取代了其他教派的包治百病的灵魂净化法。可以说，他净化了“净化”这个概念本身。
其中最低等级的是来自俄耳甫斯教的一些简单禁忌，如禁止食用肉类和豆类，因为克己忘我的苦修是最有效的净化方式。最高级的对灵魂的净化是通过冥想所有实在的本质、形式的和谐、数字的舞蹈等来实现的。因此，“纯科学”（pure science）——这个我们至今仍在使用的奇特用语——既是智性的乐趣，也是精神宣泄的方式；是通往造物的思想与其造物者的精神之间神秘联结的方式。“几何学的功能，”毕达哥拉斯学派的普鲁塔克说，“是使我们远离感官的、堕落的世界，来到智性的、永恒的世界。因为思考永恒是哲学的目的，就像沉思幽玄是宗教的目的。”但是对于真正的毕达哥拉斯信徒而言，这两者已经变得无法分辨。
不偏不倚的科学通向灵魂的净化以及最终的解脱，这一理念的历史意义极其重大。埃及人对他们的尸体做防腐处理，以便灵魂可以回到之前的身体之中，而无须转世化身；佛教徒实行无执念，以摆脱轮回。这两种态度都是消极、出世的，不具有社会意义。毕达哥拉斯派的这种令科学和对不朽者的沉思并驾齐驱的观念，借由柏拉图和亚里士多德，进入了基督教精神，成为塑造西方世界的一个决定性因素。